Долгожданное продолжение популярной серии игр о приключениях бывшего члена банды якудза по имени Кадзума Кирю. В Yakuza 3 главный герой вместе со своей приемной дочерью Харукой перебирается на Окинаву, где ведет спокойную жизнь управляющего небольшого детского приюта. Но на живописную землю на побережье, где расположен приют, появляются люди, желающие использовать ее в коммерческих целях. Кадзума вновь должен вспомнить все свои навыки для того, чтобы защитить свой новый дом и своих друзей.