В каждой главе стабильно есть 3 навыка. 1 открывается по мере прохождения после каждой главы, часть собирается на уровнях, на карте они отмечены белым камнем, и на многих главах третий камень запрятан в секретных местах, не отмеченных на карте. Подсказка где искать написана в описании закрытого навыка с сундуком в меню, всё нашёл сам, трудностей нет, главное не забывайте это делать.