Первый раз часть руки вы можете потерять в самом начале, в главе "Дежавю". Когда у вас появиться выбор "Схватить пистолет" у Слейда, выбираем этот вариант, а затем стреляем в него. Не уверен конечно, что этот сегмент необходим и является ли вообще он частью условий для выполнения данного трофея, но лучше перестраховаться.
Второй раз это станет возможно уже только в финальной битве с монстром в конце игры. В самом первом же выборе решаем "Выстрелить из оружия", а затем "Не отступать".